Sie ist aus fünf Schichten (siehe untenstehendes Schema) aufgebaut und hat eine Dicke von zentral rund 530 um und peripher rund 670 um. Zur Seite schliesst sich die Lederhaut (Sklera) an, die von der Bindehaut (Konjunktiva) bedeckt ist. Die vorderste Zelllage der Hornhaut ist das Epithel, das durch die am Rand der Hornhaut (Limbus) gelegenen Stammzellen kontinuierlich erneuert und im Falle von traumatischen Defekten repariert werden kann. Darunter liegt die festigende Bowmanschicht und das Stroma, welches für die Stabilität der Hornhaut sorgt. Auf der darunter liegenden Descemetmembran befindet sich das Endothel. Es handelt sich dabei um eine einschichtige Zelllage, deren Funktion das stete Herauspumpen von Wasser aus der Hornhaut ist. Damit wird die Transparenz der Hornhaut aufrechterhalten. Die Endothelzellen erneuern sich nicht und bei Erkrankungen oder Verletzungen kann es als Folge der Minderfunktion zu einem Anschwellen der Kornea (Hornhautödem) kommen, was zu einer Verschlechterung des Sehens und bei weiterem Fortschreiten auch Schmerzen führen kann.
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